针对问题“1987年属兔阴历9月20凌晨两三点出生的人，其五行缺什么？”我们需要通过分析八字，即出生年、月、日、时的天干地支，来推断其五行属性及缺失情况。
五行分析
1. 年份分析：1987年为丁卯年，丁属火，卯属木。
2. 月份分析：阴历九月为戌月，戌属土。
3. 日时分析：凌晨二三点为丑时，丑属土、金。
综合以上信息，我们可以得出该人的五行构成主要包含火、木、土和金。但要准确判断其五行是否有所缺失，还需根据八字整体的阴阳平衡以及五行的相生相克关系进行详细推算。
五行平衡
1. 木元素：年份及月份均含有木元素，表明木的属性较为旺盛。
2. 火元素：年份中的丁火为该人主要的火元素，但仅从年份来看，火的力量不算太强。
3. 土元素：月份和日时均有土的属性，表明土的成分较为充足。
4. 金元素：虽然日时中含金，但需综合整个八字来看金是否有所缺失。
5. 水元素：从所给信息中，水元素并未明确体现，可能存在水元素的不足。
该人八字中可能存在水元素的不足，但具体还需根据整个八字系统进行详细推算。
根据所给信息及五行学说原理，1987年属兔阴历9月20凌晨二三点出生的人，其五行中可能水元素相对不足。但确切的五行缺失情况还需结合整个八字系统进行详细推算。如需了解更多关于个人五行的信息，建议咨询专业的命理师进行详细分析。